Útskýrt: Fimm skref til að greina kransæðaveiruna (COVID-19)

Ferlið var útskýrt fyrir The Indian Express af Dr V Ravi, yfirprófessor og yfirmanni, taugaveirulækningadeild, NIMHANS.

Falsað blóð sést í tilraunaglösum merktum kórónaveirunni (COVID-19) á þessari mynd sem tekin var 17. mars 2020. (Reuters)

Dr V Ravi, prófessor og yfirmaður taugaveirufræðideildar, NIMHANS, útskýrir ferlið við að greina kransæðaveiruna til þessari vefsíðu . Hér eru skrefin fimm:

Söfnun og flutningur

Prófunarstöð tekur strok úr nefholum og aftan í hálsi (kok) og setur sýni í veiruflutningsmiðil sem inniheldur jafnvægissölt og albúmín til að koma í veg fyrir að veiran sundrast. Sýnið er síðan flutt í frystigeymslu til prófunarstofu.

Útdráttur á veiru RNA

Kórónuveiruveirur eins og SARS-CoV (sem kom fram í Kína 2002-03), MERS-CoV (sem birtist í Sádi-Arabíu árið 2012), eða núverandi SARS-CoV-2 sem hefur valdið COVID-19 heimsfaraldrinum, hafa miklar , einþátta RNA erfðamengi. Prófunarstofa dregur út RNA úr sýnunum með því að nota sett sem eru fáanleg í verslun (eins og þau sem eru framleidd af fyrirtækjum eins og QIAGEN.)

Að setja RNA í PCR blönduna

Útdregnu RNA er bætt við pólýmerasa keðjuverkun (PCR) blöndu. Þetta felur í sér „master mix“, sem inniheldur „reverse transcriptase“ ensím sem breytir RNA í DNA. Master blanda inniheldur Taq pólýmerasa, ensímið sem býr til afrit af DNA, núkleótíðum, auk annarra þátta eins og magnesíum - jón sem þarf til að magna upp DNA.

PCR blandan inniheldur einnig „hvarfefni“ eins og „primers“ og „probes“. Primers eru sérstakir DNA þræðir sem eru hannaðir til að bindast við DNA sem á að afrita; rannsakar eru notaðir til að greina tiltekna röð í DNA sýninu. WHO hefur mælt með sérstökum primers og rannsaka til að prófa fyrir COVID-19.

Að lokum samanstendur PCR blandan af heimilisgeni - venjulegu geni úr mönnum (RNase P) sem er notað til að tryggja að sýnum hafi verið rétt safnað og RNA dregið út.

Mögnun á veiru DNA

Sýni, í PCR blöndunni, er sett í rör eða plötur, sem síðan eru settar í varmahringrásarvél sem er notuð til að framkvæma PCR ferlið.

Fyrst er RNA breytt í DNA. Þá hefst ferlið við að afrita genin. Hitahringrásartækið hitar og kælir blönduna með sýninu, til skiptis á milli þriggja hitastigs - til að bræða DNA til að aðskilja þræðina tvo, til að grunnurinn bindist við DNA og til að búa til nýjan streng - allt í einni lotu sem varir í a. mínútu. Thermal cycler keyrir 30-40 slíkar lotur til að magna upp DNA til að athuga hvort veiran sé.

Prófun gegn eftirliti

Magnað DNA er prófað gegn jákvæðum samanburði, sem venjulega samanstendur af genum af veirunni sem eru klónuð í plasmíð, og neikvæðri samanburði, sem er „þekkt“ sýni sem hefur reynst neikvætt fyrir veirunni fyrr.

RNase P ætti að sýna mögnun, jákvæð viðmiðun ætti að vera jákvæð, neikvæð viðmiðun ætti að vera neikvæð, og þá er hvaða niðurstaða sem þú færð fyrir sýnið, rétt niðurstaða, sagði taugaveirufræðingur Dr V Ravi. Til þess að próf sé gilt áður en niðurstaðan er birt verða ákveðin „gildisskilyrði“ að vera uppfyllt.

Ekki missa af frá Explained | Hvernig COVID-19 prófið virkar

Ef heimilisgenið (RNase P) er jákvætt, jákvæð viðmiðun er jákvæð, neikvæð viðmiðun er neikvæð og sýnið sýnir enga PCR jákvæða niðurstöðu, er sýnið lýst neikvætt fyrir SARS-CoV-2 veirunni RNA. Ef PCR niðurstaðan er jákvæð er sjúklingurinn með COVID-19.

Deildu Með Vinum Þínum: