Útskýrt: Hvernig kórónavírusprófið (COVID-19) virkar

Hvernig lítur PCR prófið fyrir veirunni í þurrkusýnum? Hversu langan tíma tekur það? Hversu mörg sýni er Indland að prófa daglega og getur það prófað fleiri? Ef það getur, hvers vegna hefur það ekki stækkað ennþá?

Indland framkvæmir nú tveggja þrepa rauntíma PCR til að prófa fyrir SARS-COV-2. (Reuters)

Hvert er greiningarprófið fyrir nýju kórónavírusinn sem veldur COVID-19?

The Indian Council of Medical Research (ICMR) hefur sagt tilnefnd rannsóknarstofur mun nota hefðbundið rauntíma pólýmerasa keðjuverkunarpróf (PCR), sem er framkvæmt á þurrku sem safnað er aftan úr hálsi, vökvasýni úr neðri öndunarvegi eða einföldu munnvatnssýni. Slík próf eru almennt notuð við greiningu inflúensu A, inflúensu B og H1N1.

Hvað er PCR prófið?

Það notar tækni sem býr til afrit af DNA hluta. „Pólýmerasi“ vísar til ensímanna sem búa til afrit af DNA. „Keðjuverkunin“ er hvernig DNA brotin eru afrituð, veldisvísis - einn er afritaður í tvo, tveir eru afritaðir í fjóra, og svo framvegis. Kary Mullis, bandaríski lífefnafræðingurinn sem fann upp PCR tæknina, hlaut Nóbelsverðlaunin í efnafræði árið 1993.

Hins vegar er SARS-COV-2 veira úr RNA, sem þarf að breyta í DNA. Fyrir þetta felur tæknin í sér ferli sem kallast öfug umritun. Ensím „öfugrita“ breytir RNA í DNA. Afrit af DNA eru síðan gerð og mögnuð upp. Flúrljómandi DNA bindandi litur sem kallast rannsakandi sýnir nærveru veirunnar. Prófið greinir einnig SARS-COV-2 frá öðrum vírusum.

Hversu langan tíma tekur PCR ferlið?

Rauntíma PCR hefur lækkað tímann sem það tekur að prófa sýni í 4,5 klukkustundir frá um það bil 6 klukkustundum áður, sagði ICMR vísindamaðurinn Dr RR Gangakhedkar. Hins vegar er heildarafgreiðslutími - frá þeim tíma sem sýnunum er safnað þar til skýrslan er afhent - um 24 klukkustundir og ætti að vera minni, sagði hann.

Útskýrt: Fimm skref til að greina kransæðaveiruna

Hvernig er prófið gert á Indlandi?

Indland framkvæmir nú tveggja þrepa rauntíma PCR til að prófa fyrir SARS-COV-2, sagði NIMHANS prófessor og yfirmaður taugaveirulækninga, Dr V Ravi. Fyrsta stigið er hannað til að greina erfðafræðilega þætti sem eru sameiginlegir fyrir kransæðaveiru manna sem kunna að vera til í sýninu. Annað stigið er hannað til að prófa tiltekna gena sem eru aðeins til staðar í SARS-COV-2 vírusnum.

Þar til í byrjun mars var fyrstu skimun próf til að kanna hvers konar kransæðaveiru var gert af öllum rannsóknarstofum, en staðfestingar PCR var aðeins gert af National Institute of Veirufræði í Pune. Síðan flutti NIV Pune tæknina (hvarfefni sem krafist er fyrir staðfestinguna) til allra rannsóknarstofnana þannig að engin þörf væri á sýni til að fara alla leið til Pune. Þetta hefur dregið úr þeim tíma sem það tekur að prófa sýnin, sagði Dr Ravi.

Kórónuveirupróf: Falsað blóð sést í tilraunaglasi merktum kórónaveirunni (COVID-19) á þessari mynd sem tekin var 17. mars 2020. (Reuters mynd: Dado RuvicO

Er Indland að prófa nægar tölur?

Indland hefur getu til að prófa 10.000 sýni daglega og er nú að prófa um 600-700. Til samanburðar má nefna að Suður-Kórea, sem hefur svipaðan afgreiðslutíma, er að sögn að prófa allt að 20.000 sýni á dag, sérstaklega með því að nota gerðir eins og keyrsluprófunaraðstöðu sína.

Ríkisstjórnin heldur því fram að það sé ekki nauðsynlegt á þessu stigi að prófa hvern einstakling. Landið er að prófa hópinn sem það þarf að prófa núna, sagði Dr Gangakhedkar. Ef þú ferð með staðbundinni sendingu erum við að prófa nóg. Ef þú telur að það sé samfélagsbundin sending, þá er það annað mál. Það eru enn engar sannanir þar sem við vitum ekki hvernig vísitölumálið hefur fengið þessa sýkingu, sagði hann.

Express Explained er nú á Telegram. Smellur hér til að taka þátt í rásinni okkar (@ieexplained) og vertu uppfærður með það nýjasta

Við viljum ekki gera nein ósjálfrátt próf vegna þess að nú eru allir að biðja um próf. Svo einhvers staðar verðum við að hagræða því ... en það er líka mikilvægt að fylgjast með svo að við missum ekki samfélagssendingu, sagði ICMR vísindamaðurinn Dr Nivedita Gupta á blaðamannafundi í síðustu viku.

Hver verður stefnan ef samfélagssending á sér stað?

ICMR hefur eftirlit með vísbendingum um smit í samfélaginu, þar sem hver af 52 prófunarstofum Indlands prófar 20 slembisýni úr sjúklingum með alvarlega bráða öndunarfærasýkingu (SARI). Búist er við að „fyrsta niðurskurður“ þessara prófa komi út á miðvikudag. ICMR hefur sagt að ef tilfelli um flutning samfélagsins verður grafið upp úr þessum eftirlitsprófum, þá verði aðferðir stjórnvalda allt aðrar.

Coronavirus faraldur: Á sjúkrahúsi í Nýju Delí. (PTI mynd/skrá)

Eru hindranir við að stækka prófanir?

Kostnaður er hugsanleg hindrun, finnst sumir sérfræðingar. Embættismenn ICMR höfðu sagt á ráðstefnu að kostnaður við aðalpróf fyrir COVID-19 væri 1,500 rúpíur. Ef gera á annað próf til að staðfesta niðurstöður fyrstu prófsins er heildarkostnaðurinn um 5.000 rúpíur. Einn embættismannanna hafði einnig sagt að rannsakarnir sem notaðir eru, sem eru fluttir inn frá Þýskalandi, séu takmarkandi þáttur.

Þó að prófunarstöðvum hafi verið fjölgað hefur innflutningur rannsaka einnig skotist upp. Í síðustu viku vildu Indland flytja inn um 200.000 rannsaka, en á mánudag sagði Dr Gangakhedkar að stjórnvöld hygðust flytja inn um milljón.

Coronavirus heimsfaraldur: Hvenær á að prófa og hverja

Gæti Indland verið að gera hlutina öðruvísi?

Það sem Indland hafði byrjað að gera er nákvæmlega það sem mælt var með fyrir land þar sem sjúkdómurinn var fluttur inn, að sögn framkvæmdastjóra þýðingarheilsuvísinda- og tæknistofnunar Indlands, Dr Gagandeep Kang. Prófanir og eftirfylgni þeirra sem koma til landsins, og setja þá sem þeir hafa komist í snertingu við undir eftirlit, er skynsamleg og viðeigandi nálgun ef eina áhættan væri af innflutningi sjúkdómsins og eftirfylgni og prófun væri 100 %, hún sagði.

En það sem getur gerst er að með þessari sýkingu geturðu verið að losa þig jafnvel áður en þú færð einkenni, og í mjög fáum gætirðu aldrei verið með einkenni, svo þú gætir verið að senda það til annarra án þess að vita að þú ert sýkt, sagði hún. Svona flókið ... gerir það nauðsynlegt að hugsa um að hafa öryggisafritunarstefnu til að sjá hvort þú hafir í raun misst af einhverju, sagði hún. Það er fleira sem við gætum verið að gera.

Mun ICMR eftirlitið hjálpa?

Ákvörðun ICMR er gott skref, en það eru svæði sem slík æfing myndi þá sleppa, sagði Dr Kang. Ef þú ert að prófa sýni í hverri viku frá hverri inflúensustofu, ef þú finnur jafnvel eitt jákvætt, þá mun það segja þér að þú hafir misst af miklu, sagði hún.

Samkvæmt Dr Kang er mögulegt að nota stærðfræðilega líkanagerð til að skilja hvað myndi gefa stjórnvöldum sanngjarna möguleika á að bera kennsl á hvort það sé nú þegar einhver samfélagssending. Ég held að það væri frábært að hafa svona líkan sem Singapúr hefur, þar sem hvaða læknir hvar sem er sem hafði klínískan grun, jafnvel þótt það passaði ekki við lýsinguna, var leyft að senda sjúklinginn sinn í próf, bætti hún við.

– Inntak eftir Kaunain sýslumann M

Deildu Með Vinum Þínum: