Útskýrt: Hvernig TrueNat próf virkar

SARS-CoV-2 veiran, sem veldur Covid-19, hefur ekki DNA, heldur RNA sameind. Öfug umritunarferlið (RT í RT-PCR) breytir RNA í DNA sameindina áður en hægt er að fanga genið í prófinu.

Prófsýni er hlaðið á TrueNat flís. (Heimild: Molbio Diagnostics)

Fyrir nokkrum vikum samþykkti Indian Council of Medical Research (ICMR) notkun á TrueNat vélar , framleitt af fyrirtæki með aðsetur í Goa, til að framkvæma staðfestingarpróf fyrir Covid-19 sjúkdóminn. Þar áður voru þessar vélar, sem upphaflega voru þróaðar til að greina berkla hjá sjúklingum fyrir nokkrum árum, aðeins notaðar í núverandi faraldri kransæðaveirunnar til að skima sjúklinga.

Eftir samþykki ICMR eru þessar vélar nú leitað af fjölda ríkja, sérstaklega þeim sem skortir sterkt rannsóknarstofunet sem þarf til að framkvæma hefðbundnar RT-PCR prófanir. Þó að Uttar Pradesh hafi fengið 117 vélar til að dreifa í öllum sínum 75 umdæmum, hefur Bihar pantað 50 vélar. Jharkhand, Chhattisgarh, Odisha, Telangana, Andhra Pradesh hafa allir leitað eftir þessum vélum og margar þeirra hafa þegar verið notaðar.

Hvernig virkar TrueNat?

Til að skilja það hjálpar það að skilja hvernig hefðbundin PCR próf virka. PCR er aðferð til að fanga tiltekið geni úr DNA í stroksýninu og margfalda það með röð efnaferla þannig að hægt sé að greina það með flúrljómandi litarefnum. Flest nútíma PCR próf, sem eru notuð til að greina annars konar vírusa, virka í rauntíma. Niðurstaðan er sýnileg jafnvel á meðan keðjuverkun er að gerast.

SARS-CoV-2 veiran, sem veldur Covid-19, hefur ekki DNA, heldur RNA sameind. Öfug umritunarferlið (RT í RT-PCR) breytir RNA í DNA sameindina áður en hægt er að fanga genið í prófinu.

TrueNat er flís-undirstaða, rafhlöðuknúin RT-PCR sett. Upphaflega gat það aðeins greint E-genið í SARS-CoV-2 vírusnum. Þetta er genið sem hjálpar vírusnum að byggja kúlulaga hjúp utan um hana. Á þessum tímapunkti voru TrueNat vélar notaðar sem skimunarpróf. Hægt var að senda sýni sem greindust með E-geninu til staðfestingar á RT-PCR prófum á rannsóknarstofum. En nýju vélarnar eru nú búnar til að greina RdRp ensímið sem finnast í vírusnum RNA, og þess vegna hefur ICMR úrskurðað að hægt sé að meðhöndla þessar prófanir sem staðfestingu á tilvist nýju kórónavírussins.

Stóri munurinn er sá að vélin er færanleg og próf með henni kosta mun minna en hefðbundin RT-PCR próf. Það gerir það mjög gagnlegt til að dreifa í innri hverfum og fjarlægum stöðum þaðan að safna og senda þurrkur til prófunar í stórborgum er erfitt verkefni. Reyndar hafa þessar vélar þegar verið settar á vettvang í þorpum í norðurstrandbelti Andhra Pradesh og inni í skóglendi Gadchiroli-héraðsins.

Hvernig er prófið framkvæmt?

Þegar strokinu hefur verið safnað í söluturna sem settir eru upp á þessum stöðum, eða á innilokunarsvæðum eða heilsubúðum, er honum dýft í veiruflutningsmiðil þar sem því verður hlutleyst. Á heilsugæslustöðinni eða á nærliggjandi rannsóknarstofu er það flutt yfir í annan vökva, veirulýsi, þar sem frumurnar brotna og óhreinindin eru fjarlægð. Hluti af þessum vökva er síðan fluttur í hylki sem lítur út eins og fletja borðsnælda og er sett inn í vél mjög eins og kassettutæki. Spilunarhnappurinn virkjar ferlið. Á aðeins um 20 mínútum dregur ferlið út RNA, undirskriftarsett af erfðamengileiðbeiningum sem skipa frumu að fjölga vírusnum þegar hún fer inn í frumu manna. Þetta RNA útdráttur er síðan fluttur í aðra vél þar sem vökvinn er sleppt í smá brunn sem er festur við rafeindaflögu sem er ekki stærri en þumalfingur úr manni.

Þó að lítill brunnur sé þar sem hvarfefnið virkjar RNA, þá er það flísinn sem er fóðraður með öllum útreikningum á veirumagni sem hjálpar til við að greina hvort einstaklingur er með veiruna eða ekki. Ólíkt hefðbundnum RT-PCR prófunum þurfa hvarfefnin ekki háan hita í þessu ferli og magn þurrku sem þarf til prófunar er líka mun minna.

Í ljósi þess að vélarnar voru þróaðar til að prófa berkla, þurftu þær aðlögun fyrir Covid-19 próf?

Vélin, hönnuð af Molbio Diagnostics Private Limited í Goa, var upphaflega þróuð til að greina berkla, sem herja á að minnsta kosti eina milljón barna á hverju ári. Niðurstaða að minnsta kosti áratugar rannsókna var að þessar vélar höfðu nýlega verið samþykktar af Alþjóðaheilbrigðismálastofnuninni (WHO), sem staðfesti að þessar vélar sýndu svipaða nákvæmni og aðrar vörur sem WHO samþykktar í þessum tilgangi. Þessar vélar voru tilbúnar til notkunar frá og með apríl á þessu ári.

Það var þegar Covid gerðist, sagði Shiva Sriram, landssölustjóri Molbio Diagnostics, sem sat hjá framleiðsludeild Goa. Berkla krefst þess að greina hana snemma og þess vegna er mikilvægt að hafa nákvæma greiningu. Ólíkt stroksmásjánni sem hefur 50:50 nákvæmni, vildum við ná betri nákvæmni og héldum rannsóknum okkar gangandi. Það hafa verið 18 ár af rannsóknum ..., sagði hann.

Hjarta vélarinnar er hannað til að greina mismunandi tegundir sýkinga. Það er flísinn sem er sérstakur fyrir hverja sýkingu. Fyrirtækið tók 15 daga að hanna flöguna sem hafði alla veiruálagsgreiningu til að greina kórónavírus.

Að sögn Sriram var fyrirtækið önnum kafið við að gera ráðstafanir til að afhenda viðtakendalistann sem heilbrigðisráðuneytið veitti því fyrir berklagreiningu. Fimm hundruð vélum var skipt á milli allra ríkjanna og sambandssvæða. Eftir það voru ríkin farin að leggja inn pantanir á eigin spýtur. Frá og með deginum í dag eru um 1.000 vélar þegar bókaðar og við gerum ráð fyrir að 3.000 til 4.000 verði pantaðar á næstu tveimur mánuðum, sagði hann.

Það var Goa sem fyrst keypti nýju breyttu vélina fyrir Covid-19 skimun. En Andhra Pradesh var það ríki sem notaði það mest og fór yfir meira en 2,5 lakh skimunarpróf.

Eftirspurnin jókst þegar málum fór að fjölga í ríkjum eins og Bihar, Uttar Pradesh og Odisha, þegar farandverkamenn fóru að snúa aftur í annarri viku maí. Vélin hefur nú þegar virkjað kannanir frá dyrum til dyra víða í þessum ríkjum.

Hvernig er TrueNat samanborið við hefðbundin próf?

Hefðbundin RT-PCR krefst þess að RNA útdráttur og greining fari fram í tveimur mismunandi herbergjum með kæligeymslum og þjálfaðir sérfræðingar meðhöndla rannsóknarstofuhönnuð búnað. TrueNat er aftur á móti hannað fyrst og fremst til að vinna á afskekktum stöðum og talið vera „síðasta mílugreining“.

Vélin er færanleg og hægt að bera hana í skjalatösku, er rafhlöðuknúin með einni hleðslu sem endist í tíu klukkustundir. Átta tíma vakt gefur 45 próf og flest ríkin eru nú í gangi þrjár vaktir á dag, sagði Sriram. Flest ríki hafa einnig pantað fyrir fjóra spilakassa sem gerir kleift að framkvæma fjögur próf samtímis, sagði hann.

Hver af spilakössunum fjórum kostar allt að 13 lakh rúpíur en prófunarsettið kemur aðeins fyrir um 1.300 rúpíur.

Deildu Með Vinum Þínum: