Útskýrt: Hvað er „CT gildi“ í Covid-19 prófi og hvers vegna er það mikilvægt?

Þröskuldsgildi hringrásar kemur fram í RT-PCR prófum fyrir kransæðavírusinn og ákvarðar hvort einstaklingur sé jákvæður fyrir Covid-19 eða ekki. Að hve miklu leyti er það í samhengi við veiruálag og alvarleika sjúkdómsins?

RT-PCR próf greinir vírusinn; Ct gildi setur viðmið um hvort einstaklingur eigi að teljast jákvæður. (Hraðmynd: Amit Mehra)

Meðal ýmissa vísindalegra hugtaka sem Covid-19 heimsfaraldurinn hefur gert hluti af almennum orðaforða, er eitt „Ct gildi“ í RT-PCR prófum til að ákvarða hvort sjúklingur sé jákvæður fyrir Covid-19.

Þetta var efni í nýlegri beiðni sem ríkisstjórn Maharashtra sendi til Indian Council of Medical Research (ICMR). Ríkið leitaði skýringa hvort ráðlegt væri að meðhöndla einstakling sem Covid-neikvæðan ef Ct gildið er meira en 24 og viðkomandi er einkennalaus. Embættismenn ríkisins sögðu að ýmis skjöl ICMR hefðu nefnt mismunandi Ct gildi og það væru skiptar skoðanir jafnvel meðal Niti Aayog og National Center for Disease Control.

Dögum síðar skrifaði ICMR DG aftur til heilbrigðisráðherra ríkisins að ICMR hafi tekið inntak frá veirufræðirannsóknarstofum um allt land til að komast að einum Ct gildismörkum. Allir sjúklingar með Ct gildi minna en 35 geta talist jákvæðir á meðan þeir með Ct gildi yfir 35 geta talist neikvæðir, sagði ICMR.

En hvað er Ct gildi?

Stutt fyrir hringrásarþröskuld, Ct er gildi sem kemur fram við RT-PCR próf, gullstaðalinn fyrir uppgötvun SARS-CoV-2 kransæðavírussins. Í RT-PCR prófi er RNA dregið úr strokinu sem safnað er frá sjúklingnum. Því er síðan breytt í DNA sem síðan er magnað upp. Mögnun vísar til þess ferlis að búa til mörg afrit af erfðaefninu - í þessu tilviki, DNA. Þetta bætir getu prófsins til að greina tilvist vírusa. Mögnun á sér stað í gegnum röð af lotum - eitt eintak verður að tveimur, tvö verða að fjórum, og svo framvegis - og það er eftir margar lotur sem greinanlegt magn af vírus myndast.

Samkvæmt ICMR ráðgjöfinni er Ct gildi RT-PCR viðbragða fjöldi lota þar sem flúrljómun PCR vörunnar er greinanleg umfram bakgrunnsmerkið. Einfaldlega, Ct gildið vísar til fjölda lota eftir sem hægt er að greina vírusinn. Ef þörf er á fleiri lotum þýðir það að veiran hafi ekki fundist þegar fjöldi lota var lægri. Því lægra sem Ct gildið er, því hærra er veiruálagið - vegna þess að vírusinn hefur sést eftir færri lotur.

Fréttabréf| Smelltu til að fá bestu útskýringar dagsins í pósthólfið þitt

Hvers vegna er CT gildi mikilvægt?

Til að setja það í samhengi skulum við skoða ICMR ráðgjöfina og bréf Maharashtra til ICMR. Samkvæmt ICMR er sjúklingur talinn Covid-jákvæður ef Ct gildið er undir 35. Með öðrum orðum, ef veiran er greinanleg eftir 35 lotur eða fyrr, þá er sjúklingurinn talinn jákvæður. Ef viðmiðið yrði lækkað í 24 - gildið sem nefnt er í bréfi Maharashtra - myndi það þýða að Ct gildi á bilinu 25-34 yrðu ekki talin jákvæð. Viðmið upp á 35 þýðir því að fleiri sjúklingar myndu teljast jákvæðir en við myndum fá ef viðmiðið væri 24. ICMR hefur sagt að lækkun Ct þröskulds færibreytu gæti leitt til þess að nokkurra smitandi einstaklinga sakna.

Maður getur hugsað um Ct gildi sem mælikvarða á smitmöguleika, sagði leiðandi veirufræðingur Dr Shahid Jameel. Svo ef það er meiri vírus í hálsi og nefi, mun ég senda það betur, sagði Dr Jameel, sem er forstöðumaður Trivedi School of Biosciences við Ashoka háskólann.

Hvaða þýðingu hefur ICMR þröskuldinn 35?

Á heimsvísu er viðurkennd skerðing fyrir Ct gildi fyrir Covid-19 á bilinu 35 til 40, allt eftir leiðbeiningum frá viðkomandi framleiðendum prófunarbúnaðar. ICMR hefur komist að Ct gildinu 35 byggt á reynslu rannsóknarstofu og aðföngum frá nokkrum veirufræðistofum.

Það var engin ný ráðgjöf, en ICMR tilkynnti stjórnvöldum í Maharashtra að ekki væri ráðlegt að nota lægri hringrásarþröskuldsbreytu þar sem það myndi leiða til þess að missa nokkurra smitandi einstaklinga og auka sjúkdómssmit, hefur Dr Balram Bhargava, DG ICMR, sagt.

Er einhver fylgni á milli Ct gildis og alvarleika sjúkdómsins?

Nei. Þótt Ct gildi sé í öfugri fylgni við veiruálag, hefur það engin áhrif á alvarleika sjúkdómsins, hafa sérfræðingar sagt. Sjúklingur getur haft lágt Ct gildi, sem þýðir að veirumagn hennar er nógu hátt til að hægt sé að greina hana hratt, en hún gæti samt verið einkennalaus.

Lítil rannsókn sem birt var í Indian Journal of Medical Microbiology í janúar á þessu ári leiddi í ljós að engin fylgni var á milli Ct-gilda og alvarleika sjúkdóms eða dánartíðni hjá sjúklingum með Covid-19 sjúkdóm. Það kom í ljós að tíminn frá upphafi einkenna hefur sterkari tengsl við Ct gildi samanborið við alvarleika sjúkdómsins.

Ct gildið segir okkur um veiruálag í hálsi en ekki í lungum, sagði Dr Parikshit Prayag, ráðgjafi fyrir smitsjúkdóma á Deenanath Mangeshkar sjúkrahúsinu, Pune. Ct gildið tengist ekki alvarleika - aðeins við smithættu. Í fyrstu skýrslunni er ég ekki að skoða Ct gildið, en fyrir eftirfylgni sjúklinga á spítalanum, tek ég fyrir Ct gildinu, þar sem ég get ákveðið hvort ég eigi að flytja sjúklinginn í húsið sem ekki er Covid eða ekki . Frá sjónarhóli smithættu getur það skipt máli, ekki alvarleiki, sagði Dr Prayag.

Þýðir hátt Ct gildi alltaf lágt veirumagn?

Þó að það gæti verið augljós ályktun, leggja sumir sérfræðingar áherslu á að sumir sjúklingar geti haft hátt Ct gildi en samt verið með mjög verulegt magn af Covid-19 sýkingu og öfugt. Margir þættir eru mikilvægir við túlkun á RT-PCR prófi og niðurstöður geta einnig verið háðar aðferð við sýnatöku og tíma frá sýkingu til söfnunar og til greiningar.

Í ráðgjöf ICMR í ágúst á síðasta ári kom fram að Ct-gildi væru háð því hvernig sýninu hefur verið safnað. Lilla safnað sýni gæti endurspeglað óviðeigandi Ct gildi. Að auki eru Ct gildi einnig ákvörðuð af tæknilegri hæfni þess sem framkvæmir prófið, kvörðun búnaðarins og greiningarhæfileika túlkanna.

Aftur geta Ct gildi verið mismunandi milli nef- og munnkokssýna sem safnað er frá sama einstaklingi. Hitastig flutnings, sem og tíminn sem líður frá söfnun til móttöku í rannsóknarstofunni, getur einnig haft slæm áhrif á Ct gildi.

Deildu Með Vinum Þínum: