Útskýrt: Stökkbreytti kórónavírusinn á móti prófum, bóluefnum

Nýtt kórónavírus vs Covid-19 bóluefni og próf: Krónavírusafbrigðið sem er í umferð í Bretlandi er skilgreint af mörgum stökkbreytingum. Hverjar eru sérstakar áhyggjuefni? Hvers vegna hefur WHO ráðlagt að það gæti forðast sum PCR próf og getur það haft áhrif á bólusetningu?

Hettuglas af Pfizer-BioNTech Covid-19 bóluefninu á Guy's Hospital í London. Þó að vírusinn hafi stökkbreyst á sumum svæðum, beinast flest bóluefni á marga hluta. (AP mynd: Frank Augstein)

Í nýjum upplýsingum um nýja afbrigði kórónaveirunnar SARS-CoV-2 sem dreifist í Bretlandi, ein stökkbreyting hefur verið sérstaklega áhyggjuefni. Afbrigðið, sem kallast VUI 202012/01 og er greint frá því að það geti borist hraðar meðal fólks, er skilgreint af allt að 14 stökkbreytingum og þremur úrfellingum í erfðaefni þess. Sérstaklega áhyggjuefni er ein stökkbreyting, N501Y. Þó að enn sé verið að rannsaka möguleika afbrigðisins til að hafa áhrif á prófanir og bólusetningarniðurstöður, eru heilbrigðisyfirvöld að mestu bjartsýn á að flest próf og bóluefni muni enn virka.

Hvað er stökkbreyting?

Stökkbreyting þýðir breyting á erfðaefni. Í RNA veiru eins og SARS-CoV-2 eru prótein gerð úr röð amínósýra. Slík veira inniheldur um 30.000 „grunnpör“, sem eru eins og múrsteinar sem eru settir við hliðina á hvor öðrum til að mynda mannvirki. Breyting á þessum grunni getur verið stökkbreyting, sem í raun breytir lögun og hegðun vírusins.

Í breska afbrigðinu hefur ein stökkbreyting gert það að verkum að veiran tengist próteinum manna sem kallast viðtakar. Þetta er kallað N501Y.

Hvað er N501Y?

Í einföldum orðum, amínósýrunni sem táknað er með bókstafnum N, og er til staðar í stöðu 501 í erfðafræðilegri uppbyggingu kransæðaveirunnar, hefur verið skipt út fyrir aðra amínósýru, táknað með Y. Staðan þar sem þessi breyting hefur átt sér stað er í viðtakabindandi svæði spike próteins. (Það er toppprótein veirunnar sem binst viðtakanum í mönnum.)

Þess vegna hefur stökkbreytingin aukið bindandi sækni kórónavírussins. Að sögn er stökkbreytti vírusinn fyrir 60% af nýlegum sýkingum í London.

Samkvæmt gagnagrunni Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data (GISAID) hefur sömu stökkbreytingu í viðtakabindingarsvæðinu verið tilkynnt sjálfstætt í nokkrum löndum, þar á meðal Suður-Afríku og Ástralíu. Raðagreining hefur sýnt að þessi stökkbreyting átti sér uppruna í Bretlandi og Suður-Afríku.

Hvað með aðrar stökkbreytingar í kórónavírus?

Stökkbreytingar eru algengar, en meirihluti þeirra veldur engum breytingum á uppbyggingu próteina sem þeir kóða - þetta eru kallaðar „samheiti“ stökkbreytingar, þar sem þær þýða að lokum í sömu amínósýrurnar. Önnur tegund er „ekki samheiti“ stökkbreyting, sem gæti leitt til amínósýrubreytinga.

Í afbrigðinu sem er í umferð í Bretlandi eru sex samheitabreytingar og fjórtán stökkbreytingar sem ekki eru samheiti. Að auki eru þrjár „úrfellingar“ - amínósýrur fjarlægðar úr röðinni.

Samkvæmt Alþjóðaheilbrigðismálastofnuninni (WHO), öðrum en N501Y, eru stökkbreytingar sem geta haft áhrif á smitberi veirunnar í mönnum P681H og HV 69/70.

Og hvað eru P681H og HV 69/70?

P681H : Þessi stökkbreyting hefur átt sér stað í amínósýrunni sem er til staðar við 681 - önnur staða í viðtakabindandi léninu. Hér hefur amínósýrunni P verið skipt út fyrir H. Bandaríska sjúkdómseftirlitsmiðstöðin (CDC) hefur sagt að þetta sé staður með mikla breytileika í kransæðaveirum og þessi sérstaka stökkbreyting hefur líka komið fram af sjálfu sér margoft. WHO hefur sagt að þessi stökkbreyting sé líffræðilega mikilvæg.

Vísindamenn hafa áður sýnt fram á að þessi stökkbreyting getur stuðlað að inngöngu í þekjufrumur í öndunarfærum og sendingu í dýralíkönum.

Nýleg sýni sem rað voru í Afríku öndvegismiðstöðina fyrir erfðafræði smitsjúkdóma, Redeemer's University, Nígeríu hafa sýnt P681H röðina þar. Hins vegar segja vísindamenn að sem stendur hafi þeir ekki vísbendingar um að P681H afbrigðið stuðli að aukinni smiti vírusins ​​í Nígeríu.

HV 69/70 : Þessi stökkbreyting er afleiðing eyðingar á amínósýrum í stöðu 69 og 70. Þessar stöður eru aftur í topppróteini veirunnar. Þessi eyðing hefur einnig sést í Frakklandi og Suður-Afríku. CDC hefur sagt: Þessi tvöfalda eyðing hefur átt sér stað margoft af sjálfu sér og leiðir líklega til breytinga á lögun (þ.

Vísindamenn fyrir hönd COVID-19 Genomics Consortium UK (CoG-UK), sem merkti nýja afbrigðið með rauðum fána í Bretlandi, hafa sagt í bráðabirgðaskýrslu sinni að þessi eyðing hafi einnig sést í minkafaraldri í Danmörku. Hjá mönnum hefur þessi eyðing verið tengd annarri stökkbreytingu, N439K, sem kom aftur fyrir viðtakabindandi lénið.

Alþjóðaheilbrigðismálastofnunin hefur lagt áherslu á að þessi eyðing getur haft áhrif á frammistöðu sumra RT-PCR prófana sem greina nýja kransæðavírusinn.

Hvernig getur það haft áhrif á RT-PCR próf?

Alþjóðaheilbrigðismálastofnunin hefur sagt að úrfellingin í stöðunum 69/70 hafi reynst hafa áhrif á frammistöðu sumra PCR greiningargreininga sem nota „S genamarkmið“ (í „S“ eða topppróteininu). Hins vegar hefur WHO einnig sagt að flestar PCR mælingar um allan heim nota mörg markmið og því er ekki gert ráð fyrir að áhrif afbrigðisins á greiningu verði marktæk.

CDC hefur líka sagt að flest PCR próf í atvinnuskyni hafi mörg markmið þar sem þau greina vírusinn, þannig að jafnvel þótt stökkbreyting hafi áhrif á eitt af markmiðunum munu hin PCR markmiðin samt virka.

Reyndar greindist sýking af völdum nýja stofnsins í Bretlandi líka með hefðbundnu RT-PCR prófinu.

Rannsóknarstofur sem nota eigin PCR mælingar sem miða á S gen veirunnar ættu einnig að vera meðvitaðar um þetta hugsanlega vandamál. Til að takmarka áhrif á greiningargetu í löndunum er einnig mælt með nálgun sem notar mismunandi mælingar samhliða eða margfeldisprófanir sem miða að mismunandi veirugenum til að leyfa greiningu á hugsanlegum afbrigðum, sem WHO hafði mælt með.

Mun það hafa áhrif á þróun bóluefnis?

CDC hefur sagt að bóluefni samþykkt af matvæla- og lyfjaeftirliti Bandaríkjanna (FDA) séu fjölstofna og framleiði mótefni sem beinast að nokkrum hlutum topppróteinsins.

Veiran þyrfti líklega að safna mörgum stökkbreytingum í topppróteininu til að komast hjá ónæmi af völdum bóluefna eða náttúrulegrar sýkingar, sagði hún.

Og WHO hefur sagt: Rannsóknarstofurannsóknir eru í gangi til að ákvarða hvort þessar afbrigði veirur hafi mismunandi líffræðilega eiginleika eða breyti virkni bóluefnisins. Það eru ekki nægar upplýsingar sem stendur til að ákvarða hvort þetta afbrigði tengist einhverjum breytingum á alvarleika klínísks sjúkdóms, mótefnasvörun eða virkni bóluefnisins.

Deildu Með Vinum Þínum: