Útskýrt: Hver eru Covid-19 afbrigðin á Indlandi og skýra þau aukninguna?

Yfir 320 kransæðavírussýni hafa reynst hafa breska ætterni í Punjab. Útskýrir þetta nýlega aukningu? Og hversu útbreidd eru Suður-Afríku og Brasilíu afbrigði, fyrir utan önnur á Indlandi?

Í verslunarmiðstöð í Pune (Express Photo: Ashish Kale, File)

Meira en 320 kransæðavírussýni frá Punjab hafa reynst hafa ætterni í Bretlandi , tilvísun í nýjan stofn veirunnar sem hafði komið fram í Bretlandi í desember, með erfðafræðilegum stökkbreytingum sem hafa gert það kleift að breiðast út hraðar. Þetta er útbreiddasta tilvik breska afbrigðisins í indverskum stofni sem fundist hefur til þessa og gæti hugsanlega skýrt hröðu aukningu tilfella í Punjab á síðustu vikum.

Fréttabréf| Smelltu til að fá bestu útskýringar dagsins í pósthólfið þitt

Í yfirlýsingu stjórnvalda á miðvikudag sagði að 736 sýni víðsvegar um landið hefðu hingað til reynst vera af Bretlandi. Þar fyrir utan fundust 34 sýni af suður-afrískri ætt og eitt með brasilískri ætt. Suður-afríska og brasilíska afbrigðin eru tveir aðrir ríkjandi stofnar af kransæðaveiru sem dreifast um allan heim. Erfðafræðilegar stökkbreytingar í þessum tveimur afbrigðum gera þær líklegri til að flýja ónæmiskerfi mannsins. Ótti er því sá að núverandi bóluefni gætu verið tiltölulega óvirkari gegn þeim, þó að þetta sé enn í rannsókn.

Afbrigði á Indlandi

Bresk, brasilísk og suður-afrísk afbrigði eru ekki þau einu sem eru í umferð meðal indverska íbúanna. Eins og hver önnur lífvera er kransæðavírusinn líka stöðugt að stökkbreytast, þar sem nokkrar breytingar á erfðafræðilegri uppbyggingu hennar eiga sér stað í hverri afritunarlotu. Flestar þessar stökkbreytingar eru ómarkvissar og breyta ekki heildareðli eða hegðun kórónavírussins. En nokkrir þeirra, hugsanlega einn af hverjum þúsundum, geta innleitt mikilvægar breytingar, hjálpað vírusnum að aðlagast eða lifa betur af.

Meðan á þessum faraldri stendur er grannt fylgst með þrenns konar breytingum - þær sem auka getu veirunnar til að dreifast hraðar, þær sem valda alvarlegri sjúkdómi hjá sýktum einstaklingi og þær sem hjálpa vírusnum að komast undan ónæmissvöruninni.

Bresk, brasilísk og suður-afrísk afbrigði eru slíkir stofnar. Hver þeirra hefur nú sínar fjölskyldur, sem þýðir að það hafa verið margar síðari stökkbreytingar í þessum en upprunalega skilgreiningarstökkbreytingin er ósnortinn. Þessar þrjár afbrigðisfjölskyldur, eða ættir, hafa fundist í mörgum löndum og eru aðallega ábyrgar fyrir aukningu í tilfellum í Evrópu og Brasilíu.

Fyrir utan þetta eru nokkur önnur afbrigði í umferð meðal indverskra íbúa, þau sem hafa upprunninn á staðnum auk annarra sem ferðamenn hafa komið með erlendis frá. En ekkert af þessu hefur verið flokkað sem afbrigði af áhyggjum.

Covid-19 afbrigði fundust á Indlandi

Covid-19 afbrigði og áhyggjur í Bretlandi

Vísindamenn hafa haldið því fram að ekkert af þessum þremur „afbrigðum sem vekja áhyggjur“ - Bretlandi, Brasilíu eða Suður-Afríku - sé hægt að tengja við núverandi fjölgun mála á Indlandi. Algengi þeirra í samfélaginu, eins og er, er ekki svo hátt að núverandi aukningu megi rekja til þeirra.

Jafnvel í Punjab, þar sem 80% af 400 sýnum sem greind voru reyndust vera breska afbrigðið, er of snemmt að kenna því um ótrúlega fjölgun mála á síðustu vikum. Niðurstöður erfðamengisraðgreiningar hafa komið í ljós núna og þarf að gera klíníska fylgni til að meta hvort þeir séu ábyrgir fyrir fjölgun tilfella.

Eins og vísindamenn hafa bent á, ef fólkið sem smitast af breska stofninum í Punjab eru allir ferðamenn, eða beinir tengiliðir þeirra, þá væri auðvelt að útskýra atburði þeirra og eru ekki of miklar áhyggjur. Hins vegar, ef það hefur fundist í fólki í samfélaginu líka, þá er hætta á að það berist til annarra mjög fljótt. Það myndi líka þýða að einangrunar- og sóttkvíaraðferðum sem fylgt er í ríkinu, sérstaklega fyrir ferðamenn, hefur ekki verið mjög fylgt eftir.

Nokkrar sérstakar stökkbreytingar sem finnast í breska stofninum, eins og einn sem heitir E484Q og annar sem heitir N440K, hafa einnig sést í sumum öðrum afbrigðum og þær hafa verið í dreifingu í indverska stofninum í nokkra mánuði. Sem stendur eru engar vísbendingar sem benda til þess að annað hvort þessara gæti hafa leitt til seinni bylgjunnar eða valdið endursýkingu hjá sjúklingum.

Hins vegar þarf mun ítarlegri vísindarannsóknir til að meta áhrif þeirra á útbreiðslu sjúkdómsins á Indlandi.

Erfðamengi raðgreining…

Indland er með næsthæsta fjölda fólks sem smitast af kransæðaveirunni meðan á faraldri stóð. En það hefur gert mjög fáar erfðamengisraðir af mismunandi afbrigðum í umferð. Hingað til hefur það framkvæmt genagreiningu á 19.092 sýnum víðs vegar um landið, samkvæmt yfirlýsingu ríkisstjórnarinnar á Alþingi í síðustu viku. Þetta felur í sér raðgreiningu á 10.787 sýnum frá því að stjórnvöld stofnuðu INSACOG (Indian SARS-CoV2 Consortium on Genomics) í desember sérstaklega í þessum tilgangi. Mörg önnur lönd, þar á meðal Bandaríkin og Kína, hafa greint meira en 100.000 genaraðir.

Rannsókn á erfðabreytingum í lífverunni er mikilvæg vísbending til að skilja uppruna, smit og áhrif veirunnar á sjúklinga. Yfirlýst markmið INSACOG er að raða sýnunum úr að minnsta kosti 5% allra smitaðra tilfella í gegnum net tíu rannsóknarstofa. Það lítur út fyrir að vera mjög há pöntun núna. Indland hefur hingað til skráð yfir 1.17 crore jákvæð tilvik. Þau 19.092 sýni sem hafa raðgreint fram að þessu mynda aðeins 0,16% af þeirri tölu.

TAKTU ÞÁTT NÚNA :The Express Explained Telegram Channel

… og hvers vegna það hefur gengið hægt

Ein helsta ástæðan fyrir hægum hraða erfðamengisraðgreiningar hefur verið skortur á fjármagni. Enn sem komið er hefur engum peningum verið úthlutað til INSACOG, þó að embættismenn hafi sagt að samþykki fyrir fjármunum væri að vænta á hverjum degi. Rannsóknastofurnar hafa notað fé af eigin árlegum fjárveitingum til að vinna raðgreininguna. Það þarf á bilinu 3.000 til 5.000 rúpíur til að draga út genaröð eins sýnis. Kostnaðurinn er aðallega af efnafræðilegum hvarfefnum sem þarf í ferlinu.

Einnig hafa ríki ekki verið að senda sýni sín fyrirbyggjandi til rannsóknarstofanna til raðgreiningar. Maharashtra, sem hefur skráð meira en 25 lakh sýkingar fram að þessu, hefur aðeins sent um 2,800 sýni til raðgreiningar, samkvæmt gögnum stjórnvalda sem lögð voru fram á Alþingi. Það er rétt um 0,11% allra tilvika. Kerala hefur sent flest sýni til raðgreiningar, um 5.200, en Karnataka, sem er með sambærilegan fjölda tilvika, hefur aðeins sent 137 sýni. Svo lágt hlutfall erfðamengisraðgreiningar gæti ekki verið tölfræðilega marktækt til að draga ályktanir um breytt eðli og hegðun veirunnar, eða til að hanna viðeigandi inngrip til að hefta útbreiðslu faraldursins.

Þessi grein birtist fyrst í prentútgáfunni 25. mars 2021 undir titlinum „Cracking the virus strain“.

Deildu Með Vinum Þínum: